口腔科创建于1954年，当时合并于大五官科。60年代初，口腔科独立设科，并初具规模，业务上日常门诊拔、补、镶牙外，也开展中小手术。70年代开始手术范围扩大，能施行上下颌骨切除术、颌面部外伤术及涎腺手术等。80年代除中小手术外，还开展上下颌骨肿瘤切除术、颞颌关节成形术等1984年口腔科教学从外科教研室分出，正式成立口腔科学教研室担负起医学院医疗系、儿科系授课以及临床实习教学工作、还担负浙医大口腔系连续四届毕业实习教学的任务。90年代是我科各项专业发展较快的年代。进口10台西门子综合治疗台。2003年担负口腔医学本科口腔颌面外科教学任务。2002年成立了口腔颌面外科中心，病房搬入新的急诊大楼，床位增至19张，颌面外科中心实力大大增强，开展的手术量也大幅度增加。2004年口腔临床医学(口腔颌面外科)被评为温医重点学科。2002年被评为院重点扶植学科。
2005年成为国家药监局的临床药物和医疗器械试验基地，开展了多项国内外临床药物和医疗器械的临床试验。2006年在原口腔科的基础上结合其它相关医技科室组建成立口腔医疗中心，2007年成为国家口腔专科医生临床培训基地。同时中心还是全国微笑列
