健康心理科将以预防心理疾病发生为目标，有效地融合并利用了“中心”的医学与非医学背景的相关心理学资源，为有各类心理卫生问题，如工作压力、情感困惑、学生厌学等提供专业的心理咨询服务的基础上，重点为正常人群提供心理保健、个人职业规划、企事业EAP服务、心理咨询师培训及执业教育等。健康心理科组织成立了康宁心理咨询师俱乐部，为心理咨询师提供成长的平台，定期开展案例讨论、专业读书会、心理沙龙等形式多样的活动。温州市康宁精神卫生研究所健康心理研究室挂靠于我科室。 健康心理科现有专兼职心理咨询师、心理康复师12名，现任负责人冯睿华主任、丛戎副主任。